Recrutement

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NB : Si vous souhaitez diffuser une offre de stage, de thèse ou d'emploi en sciences séparatives, merci de nous transmettre vos offres de recrutement dans l'espace pratique/contact.

These : PhD position in analytical pharmaceutical chemistry

Edité le 22/08/2017

Location: analytical pharmaceutical chemistry research unit of the Geneva-Lausanne School of pharmaceutical sciences, Geneva, Switzerland

Title: Evaluation of supercritical fluid chromatography (SFC) and its coupling with mass spectrometry (MS) for pharmaceutical analysis.

Project description:

The goal of this PhD work is to evaluate the possibilities of supercritical fluid chromatography (SFC) in the pharmaceutical analysis. This chromatographic approach will be used to develop analytical methods for numerous types of drugs (including chiral ones) in pharmaceutical formulations. Some inventive strategies will be developed to maximize performance and apply SFC to the widest possible range of molecules. The performance of SFC will be systematically compared to liquid chromatography (LC). In parallel, the PhD candidate will also have the opportunity to couple SFC with single quadrupole(MS), triple quadrupole (MS/MS) and high resolution (QqTOF/MS) mass spectrometers available in our laboratory. This instrumental setup will be used for the determination of drugs and metabolites in complex matrixes, such as biological fluids.

Start: 1st of January 2018 Duration: 4 years

Supervision: Prof. Jean-Luc Veuthey, Dr Davy Guillarme


Salary: The salary will follow the Geneva-Lausanne School of Pharmacy standards.

Requirements: The candidate holds a master degree in pharmaceutical sciences, pharmacy, or an equivalent degree. The ideal candidate is highly motivated, team player, well organized, French speaking, and has good oral and written communication skills
in English. Good knowledge in chromatography and/or mass spectrometry will be an asset. The PhD student will have a position of part-time assistant. He/she will participate to teaching activities for undergraduate students.


If you are interested by the position, please send your CV, cover letter, recommendation letter(s) and academic grades of the last two years to Dr Davy Guillarme (davy.guillarme@unige.ch) before the 30th of September 2017.

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Post-doc : Offre de post doc de 18 mois à l'université de Rouen

Edité le 22/08/2017

Title: Development of quantitative methods for  hydrocarbons, sulfured and nitrogen compound characterization in  Vacuum Gas Oil by HT-GCxGC

Post-Doc with the University of Rouen in collaboration with Total.

Location: in the R&D Research Center TRTG of Total close to Le Havre (France)/Laboratory SMS EA3233 University of Rouen (France).

Main goal of the study :

The new challenge for the oil industry is the exploitation of increasingly heavy conventional crude oils and unconventional crude oils whose compositions are still poorly known. The refining processes must be optimized in order to be able to efficiently convert the heavy cuts resulting from these crudes, such as vacuum distillates, into products with high added value (gasoline, gas oil, etc.) and thus satisfy an ever-increasing market.

This optimization requires a detailed characterization of the complex petroleum fractions. High-temperature comprehensive two-dimensional gas chromatography "HT-GCxGC", thanks to its high peak capacity, has already demonstrated its high separation power for this type of cuts (Duhamel et al. Journal of Chromatography A, 1387 (2015) 95–103). An analytical method has been developed, allowing to elute compounds up to n-C60, and to organize vacuum distillate sections by chemical families. New couplings of HT-GCxGC with differential flux modulation to specific detection with sulfur chemiluminescence (SCD) and nitrogen (NCD) as well as to mass spectrometry (HR-TOF) will be developed. The next step will also be the development of quantitative HT-GCxGC methods. For this purpose, all parts of the GCxGC must be optimized, from the injection to the quantification, to the reliability of the stationary phases and a better understanding of the flow management in the modulator.


Start September 2017


Contact: Prof Pascal Cardinael

Email: pascal.cardinael@univ-rouen.fr

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Emploi : Responsable (H/F) en Chimie Analytique et Spectrométrie de Masse

Edité le 28/07/2017

Laboratoire des Courses Hippiques
15, rue de Paradis
91370 Verrières le Buisson - FRANCE


Responsable (H/F) en Chimie Analytique et Spectrométrie de Masse

 


Le Laboratoire des Courses Hippiques (LCH), situé à Verrières-le-Buisson (91), réalise l'ensemble des analyses de contrôle anti-dopage des chevaux de courses en France (30 000 / an) et réalise aussi des analyses sur des prélèvements provenant d'autres pays (10 000 / an).
La personne recrutée devra assurer le développement de méthodes analytiques, la gestion de projets, la maintenance des instruments analytiques dédiés (LC-MS/MS, GC-MS/MS) en respectant les exigences du travail sous assurance qualité ISO 17025. Le candidat devra aussi réaliser une veille bibliographique relative aux projets et valoriser les résultats scientifiques (articles, communications orales).
De formation scientifique (doctorat en chimie analytique ou équivalent), avec un bon niveau d'anglais (lu, écrit, parlé), une aptitude et un goût pour l'encadrement ainsi qu'une première expérience professionnelle dans le domaine de la chimie analytique, le candidat devra posséder de solides connaissances en chromatographie et spectrométrie de masse. Au cours de sa formation et/ou de son expérience professionnelle, le candidat aura contribué à des développements et/ou validations de méthodes notamment sur des matrices complexes.
Des connaissances en métabolisme et/ou chimie des stéroïdes seraient un plus.
Merci d'envoyer un CV de deux pages maximum ainsi qu'une lettre de motivation en indiquant vos références professionnelles à Dr Ludovic Bailly-Chouriberry : lch@lchfrance.fr. Le poste sera à pourvoir en septembre 2017.

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Stage : offre de stage M2 Strasbourg

Edité le 11/07/2017

Chromatographie liquide à haute température utilisant l'eau à l'état subcritique comme phase mobile alternative aux solvants organiques

 

 

L'activité chimique des industries et des laboratoires de recherche ou de contrôle a des conséquences néfastes sur l'environnement. La préoccupation grandissante des gouvernements pour la protection de l'environnement impose aux chimistes, y compris aux spécialistes de la chimie analytique, de développer une chimie plus respectueuse de l'environnement, une chimie dite « verte », non polluante. Elle englobe la conception de produits et de procédés chimiques qui réduisent ou éliminent totalement l'utilisation et/ou la production de substances nuisibles à notre santé et à l'environnement.

Des efforts considérables ont déjà été réalisés dans les étapes de préparation des échantillons et également dans les techniques de séparation, on peut citer par exemple, la chromatographie liquide à ultra-haute performance (CLUHP) qui permet grâce à la réduction de la taille des particules de phase stationnaire et/ou du diamètre des colonnes, de réduire considérablement le temps d'analyse et la consommation de solvants ; ou encore la chromatographie à fluide supercritique (CFS), la CLHP micro-ou nanométrique, et la chromatographie liquide à haute température (CLHT). Ces techniques se sont révélées être prometteuses sur le plan environnemental en réduisant la quantité de déchets générés par l'analyse. La CLHT, en particulier, présente de nombreux avantages, on peut citer la possibilité de réaliser des séparations très rapides. En effet, sous l'action de la température, la viscosité des phases mobiles et les contre-pressions sont réduites permettant ainsi de travailler à des débits plus élevés (3 ml/min). De plus, les quantités de solvants organiques utilisées peuvent être réduites, voire même remplacées par de l'eau. Sous pression et à des températures entre 100 et 250°C, le pouvoir éluant de l'eau en phase inverse augmente en effet fortement et peut agir comme éluant unique. Cette technique offre donc la possibilité de permettre des méthodes d'analyses dites « vertes » respectueuses de l'environnement, en réduisant l'usage de solvants et de réaliser des économies substantielles dans les coûts d'utilisation et d'élimination des solvants organiques. Enfin, elle présente l'avantage d'élargir le choix des systèmes de détection utilisables ; par exemple en permettant la détection à des longueurs d'ondes faibles, ce qui n'est pas toujours possible lorsqu'on utilise des solvants organiques.

Le vif intérêt pour cette technique a été rendu possible, non seulement grâce au développement depuis quelques années de nouvelles phases stationnaires thermiquement stables, composées de matériaux résistants tels que le carbone graphité, la zircone, mais également grâce à la mise sur le marché de systèmes de chauffage performants. Toutefois, la CLHT peine à se développer, essentiellement en raison de préoccupations concernant la thermo-stabilité des analytes.

L'objet de cette étude est de démontrer la faisabilité du remplacement des mélanges organiques utilisés dans les méthodes standards par des solvants dits « verts » ou par uniquement de l'eau grâce à l'utilisation de températures élevées lors de la séparation. Le projet s'intéressera aux méthodes les plus largement utilisées par les laboratoires de contrôle et de recherche dans les domaines pharmaceutiques et alimentaires. En effet, ce sont deux secteurs où le plus grand nombre d'analyses est réalisé quotidiennement par CLHP pour le contrôle de substances actives ou de constituants. Les objectifs seront donc de réduire les quantités de solvants organiques utilisées lors de ces contrôles tout en conservant les performances analytiques afin d'assurer leurs conformités aux normes en vigueurs, et également de montrer les avantages écologiques et économiques de l'utilisation de la CLHT.

 

 

Laboratoire : IPHC, département des Sciences Analytiques, équipe CAMBA,

Faculté de Pharmacie, 74 route du Rhin, 67400 Illkirch-Graffenstaden.

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Stage : Offre de Stage M2 en alternance à Paris

Edité le 29/06/2017

Ingénieur analyse ADN - Alternance

Présentation de la société

Basée en plein cœur de Paris, la société DNA Script développe, en partenariat avec l'Institut Pasteur et l'ESPCI, une technologie révolutionnaire de synthèse d'ADN. Inspirée par la nature, notre technologie enzymatique a le potentiel de rendre la synthèse d'ADN considérablement plus rapide et moins chère.

Cette rupture technologique jouera un rôle clé dans le développement des biotechnologies, en permettant « d'écrire » des séquences d'ADN plus longues, avec une meilleure qualité et à un coût réduit. Elle permettra ainsi d'accélérer l'émergence de la biologie synthétique et de l'industrie du futur.

DNA Script compte 13 employés, a déjà levé près de 5 M€ auprès d'investisseurs européens renommés dans le secteur des biotechnologies et des sciences de la vie et prépare une prochaine levée de 10 M€ d'ici à la fin de l'année.

 

Poste à pourvoir

DNA Script possède une plateforme d'analyse composée de plusieurs équipements (électrophorèse capillaire Agilent 7100, chromatographie liquide UPLC H Class Waters, et spectromètre de masse simple quad, SQD2 Waters) permettant de déterminer la pureté d'un échantillon d'ADN.

Le candidat mènera une étude comparative des différentes techniques utilisées pour l'identification de la longueur d'un fragment d'ADN ainsi que pour la quantification de la pureté d'un échantillon d'ADN.

Pour ce faire, le candidat aura pour mission l'optimisation de méthodes d'analyse existantes et le développement de méthodes de quantification, en particulier en spectrométrie de masse.

 

Opportunités et défis

Nous souhaitons mettre en place une équipe innovante, passionnée et performante capable de mettre ses compétences au service d'un but : celui d'amener la prochaine génération de synthèse d'ADN sur le marché.

Nous offrons une opportunité unique de jouer un rôle essentiel dans la croissance d'une startup de biotechnologies à fort potentiel.

 

Compétences exigées

● Connaissance théorique et pratique HPLC, EC, Fluo, MS

● Rigueur ● Autonomie ● Connaissances de biologie moléculaire

● Bonne communication Compétences souhaitées

● Anglais courant

 

Expérience souhaitée

Alternance M2

 

Contact Xavier GODRON – Cofondateur – xg@dnascript.co - +33 6 14 27 00 21

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These : Offre de Thèse à Toulouse

Edité le 04/05/2017

Sujet de la thèse: Utilisation de la CE/UV/ESI-MS, pour l'analyse de composés issus de l'acide arachidonique impliqués dans les processus d'inflammation.

 

Laboratoire d'accueil: Laboratoire des IMRCP UMR CNRS 5623

 

Encadrants: Dr Véréna Poinsot et  Pr François Couderc

 

Résumé du projet de Thèse:

Les multiples effets anti-inflammatoires des acides gras polyinsaturés ont été mis en évidence dans les tissus des patients atteints de différentes maladies inflammatoires chroniques.

Il a été montré que ces effets dépendent de plusieurs mécanismes : une diminution importante de la réaction inflammatoire est corrélée à la diminution de la synthèse de produits de l'acide arachidonique (C20) comme le leucotriène B4 (LTB4, C20 tétra-insaturé dihydroxylé) de la protaglandine E2 (C20 di-insaturé, di-hydroxylé,  contenant une cétone et un cyclopentane) , du thromboxane B2 (C20 di insaturé di-hydroxylé avec un cycle tétra-hydropyranoyl portant une fonction hemi-acetal) de l'acide 5-hydroxyeicosatétraénoïque ( C20 mono hydroxylé, tétra-insaturé) et une inhibition de la production de protéines appelées cytokines proinflammatoires. Les acides gras impliqués dans l'inflammation sont très variés et peu stables.

 L'étude de ces molécules dans les milieux biologiques en particulier dans les plaies, constitue un secteur de la biochimie analytique qui peut être traité soit par la GC/MS ou la LC/MS-MS. Mais ces techniques souffrent pour la première de la difficulté de réactions de dérivation pour les rendre volatiles, soit pour la seconde d'un manque de résolution chromatographique due à leur longue chaine carbonée et leur isomérie qui rend la MS parfois difficile d'utilisation par son manque de sélectivité à doser ce type d'isomères. Une autre caractéristique de ce type de composé est leur aptitude à l'auto-organisation en solution qui joue sur leur activité biologique et sur leur efficience de séparation analytique.

Ainsi il faut pouvoir séparer mieux les espèces lipidiques impliquées dans ces phénomènes d'inflammation.

L'électrophorèse capillaire a été peu utilisée pour l'étude des lipides en effet les deux problèmes principaux, sont leur très faibles solubilités dans l'eau et la difficulté qu'il y a de les détecter en détection par absorption UV. Dans notre cas la solubilité est un problème aisément résolu soit par l'utilisation d'électrolytes tampon contenant des solvants organiques, des cyclodextrines ou des systèmes micellaires. Par ailleurs les composés issus de l'acide arachidonique absorbent légèrement en UV et donc cette application pourra aussi utiliser ce mode aisé de détection. La capacité d'auto-organisation de ces molécules pourra être mise à profit, en électrophorèse capillaire et sera étudiée avec l'équipe SMODD du laboratoire.

Nous proposons de travailler sur la mise au point de cette séparation en électrophorèse capillaire couplée à la spectrométrie de masse CE/UV/ESI-MS. Pour ce faire il faudra travailler sur la compatibilité du tampon de séparation, du « sheath flow » de l'ESI-, et de l'ESI-MS.

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These : Offre de thèse à l'ICOA Orléans

Edité le 08/03/2017

L'ICOA propose une offre de thèse sur le thème: Etude du métabolisme des nucléosides au niveau cellulaire par suivi enzymatique en EC-HRMS / CE-HRMS platform for nucleoside metabolism study in cell through enzyme kinetics

Durée et date de début: 3 ans, début de préférence : le 1 octobre 2017

Laboratoire d'accueil: Institut de Chimie Organique et Analytique (ICOA) - UMR 7311. Université d'Orléans

Equipe : Stratégies analytiques, Affinités et Bioactifs (SAAB)

Personnes à contacter: Reine Nehmé et Philippe Morin

Résumé :

Le métabolome d'une cellule définit en partie son phénotype métabolique et son analyse permet de comprendre un grand nombre de phénomènes, en particulier la variabilité des processus biologiques ainsi que l'hétérogénéité fonctionnelle des cellules (Altschuler et al., cell 2010. Spiller et al., Nature 2010). D'un point de vue analytique, les cellules sont des échantillons de très faible volume qui contiennent une grande variété de métabolites aux propriétés physico-chimiques diverses et aux concentrations différant de plusieurs ordres de grandeur. Les techniques séparatives couplées à des instruments d'analyse récents, tels que la spectrométrie de masse à haute résolution (HRMS), offrent des possibilités puissantes d'analyse de ces métabolites. Parmi celles-ci, l'électrophorèse capillaire (CE) couplée à la spectrométrie HRMS permet de réaliser des analyses rapides qui ne nécessitent que de faibles volumes d'échantillons injectés (quelques nLs) pour identifier et quantifier les métabolites contenus dans une cellule (Lapainis et al., Anal. Chem. 2009). 
Dans cette thèse, nous envisageons de développer une plateforme EC-HRMS qui permette l'étude du métabolisme cellulaire et le suivi des cinétiques enzymatiques. Comme preuve de concept, le métabolisme d'analogues nucléosidiques dans un fibroblaste sera étudié en EC par la détermination des constantes cinétiques (Km, Vmax, IC50) de plusieurs kinases virales et cellulaires impliquées dans leur activation ainsi que de polymérases. Notre recherche sera menée en utilisant comme modèle deux agents antiviraux, l'aciclovir et le cidofovir, utilisés pour la prise en charge des infections par le virus de l'herpès simplex (HSV). Les dosages seront développés en utilisant des enzymes purifiées, des lysats de cellules de fibroblastes puis des cellules entières. La quantification des produits enzymatiques et/ou des substrats par le CE-HRMS permettra de suivre le métabolisme de ces analogues de nucléosides. Des collaborations nationales et internationales seront impliquées pour garantir le succès du projet.

Abstract
Investigating the composition of the cellular metabolome is important for understanding a variety of phenomena, including single-cell biological variability and functional heterogeneity (Altschuler et al., cell 2010. Spiller et al., Nature 2010). Cells represent volume-limited samples containing a wide variety of metabolites with different physico-chemical properties and concentrations that span orders of magnitude. Chemical separations hyphenated to recent instrumentation such as high resolution mass spectrometry (HRMS) offer powerful options for metabolite analysis. Among the separation methods, capillary electrophoresis (CE), with its nano-sample volume requirements and fast analysis time, enables microanalyses that include profiling and quantitation of metabolites in single cells (Lapainis et al., Anal. Chem. 2009).
In this thesis, we intend to develop a CE-HRMS platform that enables studying metabolism in cells through monitoring of corresponding enzyme kinetics. As a proof-of-concept, the metabolism of nucleoside analogs (NA) in single fibroblast will be studied through CE monitoring of the kinetics (Km, Vmax , IC50) of cellular and viral kinases and polymerases involved in their activation. Our research will be conducted using as model two NA antiviral agents, aciclovir and cidofovir, employed for the management of Herpes Simplex Virus (HSV) infections. Assays will be developed using purified enzymes, fibroblast cell lysates and then entire cells. Quantifying enzymatic products and/or substrates by CE-HRMS will allow monitoring NA metabolism. National and international collaborations will be implicated in order to ensure the success of the project.

Références
1. P. Morin et al., Hyaluronidase reaction kinetics evaluated by capillary electrophoresis with UV and high-resolution mass spectrometry (HRMS) detection. Anal. Chim. Acta, 2017, 951, 140–150.
2. P. Morin et al., Human neutrophil elastase inhibition studied by capillary electrophoresis with laser induced fluorescence detection and microscale thermophoresis. J. Chromatogr. A 2016, 1431, 215-223.
3. H. Bénédetti et al., New in-capillary electrophoretic kinase assays to evaluate inhibitors of the PI3k/Akt/mTOR signaling pathway. Anal. Bioanal. Chem. 2014, 406, 3743-3754.
4. P. Morin et al., Electrophoretically mediated microanalysis for in-capillary electrical cell lysis and fast enzyme quantification by capillary electrophoresis. Anal. Bioanal. Chem. 2013, 405, 9159-9167.

 

Profil du candidat: 

Qualifications souhaitées:  Ingénieur Chimiste, Master 2 Chimie Analytique

Connaissances linguistique : Anglais

Autres qualifications :  Solides compétences en Sciences Séparatives et Spectrométrie de masse. Connaissances en Biochimie.
 

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These : Offre de thèse à l'IFP Energies nouvelles

Edité le 09/01/2017

INTITULE DU SUJET : Spectrométrie de masse en couplage avec la chromatographie en phase liquide vers une description plus détaillée des matrices complexes oxygénées et hydrocarbonées.

Mots clefs: chromatographie en phase liquide, spectrométrie de masse, couplages, biomasse, produits
pétroliers

 

RESUME : 

Pour répondre aux défis du domaine de l'énergie, IFP Energies nouvelles travaille à la transformation de la biomasse  lignocellulosique en biocarburants et en molécules plateformes biosourcées ainsi qu'au développement, pour l'industrie pétrolière, de procédés moins consommateurs d'énergie et davantage respectueux de l'environnement. La connaissance détaillée des produits générés est essentielle pour développer des procédés et des catalyseurs performants. Or la complexité chimique de ces matrices limite leur caractérisation moléculaire. Les couplages entre chromatographie en phase liquide et spectrométrie de masse (LC/MS) sont à privilégier pour identifier les molécules contenues dans ces matrices. Cette thèse a pour objectif de développer de nouveaux outils comme un couplage LC-UV/MS/MS permettant de combiner une information structurale aux données classiquement accessibles par chromatographie en phase liquide afin de proposer une structure pour chaque espèce détectée dans une solution chimique complexe. L'aspect quantification des molécules fera également l'objet d'études dédiées. La méthodologie expérimentale et théorique développée sera appliquée sur des molécules modèles ainsi que sur des produits issus des travaux de recherche et innovation menés par IFP Energies nouvelles.

Directeur de thèse: Dr CHARON Nadège

Ecole doctorale ED206: Ecole doctorale Chimie

Encadrant IFPEN: Dr LE MASLE Agnès,

Localisation du doctorant: IFP Energies nouvelles, Lyon, France

Durée et date de début: 3 ans, début de préférence : le 1 novembre 2017

Employeur: IFP Energies nouvelles, Lyon, France


Qualifications souhaitées:  Ingénieur Chimiste, Master 2 Chimie Analytique

Connaissances linguistique : Anglais

Autres qualifications :  Solides compétences en Sciences Séparatives et Spectrométrie de masse

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Emploi : Technicien en chimie analytique

Edité le 19/12/2016

Le Centre International de toxicologie (CITOXLAB) recherche un technicien en chimie analytique.

Durée du contrat: 6 mois

Localisation: Evreux (27)

Notre organisme:

Le groupe CiToxLAB offre une vaste gamme de services précliniques pour répondre aux besoins des sociétés pharmaceutiques, biotechnologiques, chimiques, cosmétiques et agro-alimentaires au niveau international.
Avec ses 5 centres localisés en France, Canada, Danemark et Hongrie, CiToxLAB est un acteur préclinique majeur dont la mission est principalement d'évaluer les nouveaux médicaments. Ses 800 salariés – dont 300 salariés sur le site d'Evreux – réalisent des études de sécurité (toxicologie notamment), de pharmacologie, de bioanalyse, d'immunologie et de pharmacocinétique. Grâce à ses cadres scientifiques de haut niveau et des installations ultramodernes, CiToxLAB répond aux normes les plus élevées en matière d'évaluation préclinique et compte aujourd'hui plus de 400 clients, dont 9 des 20 premières sociétés pharmaceutiques mondiales. Ses multiples implantations lui permettent également d'apporter à ses clients une grande flexibilité ainsi qu'un accès direct aux experts.

Vos missions:

Au sein du service du service d'analyses pharmaceutiques, vous aurez pour principales missions sous la responsabilité du responsable de service de :

  • Effectuer les opérations nécessaires à la conduite des tâches ou des études dont vous serez responsable, conformément aux bonnes pratiques de laboratoire, aux procédures standards, aux protocoles d'études et au règlement intérieur du Centre.
  • Appliquer progressivement certaines techniques analytiques du laboratoire (HPLC/UV, GC/FID, LC/MS-MS notamment)
  • Réaliser la conduite de dosages comprenant notamment: les prélèvements et préparations d'échantillons, analyse par les techniques précitées, gestion des données et des résultats, saisie informatique des résultats.
  • S'assurer de la conformité des résultats obtenus
  • Lire les protocoles, avenants et notices en anglais
  • Transmettre à votre supérieur hiérarchique et/ou au directeur d'études les informations concernant tout événement survenant au cours de votre travail.
  • Pouvoir participer à la manipulation, au traitement et à l'entretien des animaux, du matériel ou des locaux.

Votre profil:

Vous possédez un DUT/BTS (chimie ou bioanalyse et contrôle) ou une licence professionnelle de chimie analytique, idéalement avec une expérience professionnelle significative de de 3 ans minimum de technicien(ne) avec une pratique soit de HPLC/UV, soit de GC/FID.
La maîtrise du logiciel Empower serait un avantage
Vous êtes autonome et vous êtes à l'aise en informatique.
Vous possédez une aisance relationnelle et un sens du contact et du service
Vous êtes organisé(e), vous appréciez de travailler en équipe et en réseau
Vous êtes rigoureux(se), vous respectez les délais, les procédures et les consignes
Votre anglais est opérationnel et vous êtes à l'aise en anglais scientifique écrit
Vous pourrez travailler en horaire décalé selon les études en cours
 

Pour candidater:

Envoyer un CV et une lettre de motivation à l'attention de Mélinda LE BRETON à l'adresse recrutement@fr.citoxlab.com avec les références TKCHIAPC4/17

 
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Stage : Evaluation des variations structurales hydrophile et hydrophobe d'oligonucléolipides sur les paramètres chromatographiques

Edité le 30/11/2016

Les protéines sont essentielles au bon fonctionnement du corps humain. Cependant lorsque certaines protéines sont surexprimées, les cellules développent un phénotype anormal voir cancéreux. Afin de réguler l'expression de ces protéines, il est possible d'utiliser certaines molécules dont le mécanisme d'action est de bloquer la surexpression des protéines responsables. Parmi ces outils, les oligonucléotides antisens (ASO) permettent de s'hybrider spécifiquement à une séquence d'ARN afin d'inhiber sa traduction et donc la production de protéine.1,2
Les ASO sont de courtes séquences d'ADN qui peuvent être modifiées chimiquement afin d'augmenter le potentiel d'action ou d'éviter leur dégradation par des nucléases extracellulaires. Cependant, l'inhibition étant intracellulaire, des agents de transfection sont indispensables pour la vectorisation cellulaire. Ces agents de transfection sont toxiques in vivo, ce qui ne permet pas l'utilisation de ces outils en thérapeutique. L'équipe du Pr P.Barthélémy en collaboration avec l'équipe du Dr P.Rocchi au CRCM à Marseille ont démontré que l'ajout d'une partie apolaire à l'ASO engendrait une organisation supramoléculaire (objet micellaire)3,4 permettant une autovectorisation intracellulaire.

La purification après synthèse se fait majoritairement par HPLC, mais les caractéristiques physico-chimiques sont modifiées lors de l'ajout de la partie hydrophobe sur l'ASO et sont de nature très différente. L'objectif est une approche systématique de l'étude de la diversité structurale des parties hydrophile et hydrophobe par deux modes chromatographiques RP et HILIC associée à une approche par plan d'expériences 5, afin d'établir quels sont les paramètres chromatographiques pertinents et corrélés avec hétérogénéité structurale.
Références :
(1) Zamecnik, P. C.; Stephenson, M. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1978, 75 (1), 280
(2) Stephenson, M. L.; Zamecnik, P. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1978, 75 (1), 285
(3) Gissot, A.; Primo, C. D.; Bestel, I.; Giannone, G.; Chapuis, H.; Barthélémy, P. Chem. Commun. 2008, 43, 5550
(4) Patwa, A.; Gissot, A.; Bestel, I.; Barthélémy, P. Chem. Soc. Rev. 2011, 40 (12), 5844
(5) C. Boussès, L. Ferey, E. Vedrines, K. Gaudin, JPBA, 2015, 115, 114-122
Période du stage : Janvier 2017 à juin 2017

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